MicroRNA靶基因预测及功能注释

MicroRNA对转录本进行转录后调控，在生物生长发育过程中起着及其重要的调控作用。根据研究报道，microRNA不仅能引起mRNA的降解及阻碍蛋白质的翻译，还能够通过影响mRNA及蛋白质的构象，从而影响重要蛋白质功能的正常发挥。目前主要的分析方法还是通过研究microRNA调控的靶基因，从而间接分析microRNA对样本产生的影响。我们通过多个知名的microRNA的靶基因预测数据库中已验证的microRNA靶基因作用关系(validated miRNA-target interactions)对microRNA的靶基因进行准确预测，并进行功能注释。多数据库交叉验证，使得结果非常可信。

下图1为人前列腺癌代谢通路中各基因与其作用的microRNA关系图的一部分。图中圆形结点为基因或其产物，方形结点为microRNA，黑色连线为基因-基因相互作用关系，彩色连线为microRNA-基因作用关系，箭头代表作用方向，结点的颜色为基因或microRNA的差异比值，灰色为缺少数据的结点。

不仅可以通过表达结果来标注microRNA，还以用microRNA的相关功能分类来标注。透过直观的图形，能从复杂的作用关系网络中找到关键的基因及microRNA。

图1 microRNA靶基因关系网络图