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荧光探针实时荧光PCR比荧光染料实时荧光PCR定量准确可靠,是这样吗?
这种理解不全面。应该说,荧光探针PCR因为引入了专一性探针,PCR反应专一性增强了。但这并不意味着荧光探针PCR比荧光染料PCR定量更准确可靠。荧光探针在最理想的情况下,就是区别了专一性扩增产物和非专一性扩增产物,使得非专一性扩增产物不被检测到。假如一个充分优化的PCR反应,只有专一性扩增产物,没有非专一性扩增产物,那探针的作用就仅仅是产生荧光信号。但引入荧光探针,成本大大提高,而且体系变得复杂,优化也相对困难。很多荧光探针PCR经凝胶电泳分析有多种杂带,虽然因为探针能分辨专一性和非专一性产物,这些杂带是乎不影响专一性,但实质上对PCR性能是有影响的。第一,非专一性产物的存在,势必消耗反应体系资源,降低扩增效率;第二,非专一性产物的存在,影响PCR的灵敏度。而且PCR的规律是彼消我涨,在检测目标越少时,非专一性扩增影响越大。所以,非专一性产物的存在,势必降低PCR灵敏度。第三,假如定量标准没有出现非专一性产物而样品出现,那么定量结果会出现偏差。 荧光染料PCR不能区分专一性和非专一性产物,因此优化过程格外重要。但假如优化好了,没有非专一性产物,而且稳定,抗干扰性强,那么它的定量准确可靠。而且现在的实时荧光PCR仪都可以做溶解曲线。通过溶解曲线分析,能区分产物是否为引物二聚体。 在临床诊断上,从PCR实验到临床报告按固定的流程进行,一般不普遍对结果做多次重复,特别强调专一性,因此均采用荧光探针PCR。在科研上,一个重要结果会通过多种方法反复求证,由于荧光染料PCR的高性价比,科研上经常采用。

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