技术支持

miRNA系统命名简介
MiRNA的命名原则可以大致归纳如下:

一个系统命名包含三部分内容,即物种,microRNA类别,序号。三者间用短线连接。物种一般用三个小写字母表示,如hsa,mmu和rno分别代表人,小鼠和大鼠。MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miRNA。pre-miRNA用mir表示,mature miRNA用miR表示。序号为一阿拉伯数字,代表microRNA发现的先后。一般而言,数字越小,发现越早。

位于基因组不同部位但产生同样的mature miRNA的pre-miRNA在序号后添加短线和阿拉伯数字以示区别,如hsa-mir-7-1, hsa-mir-7-2, hsa-mir-7-3。

有些pre-miRNA可以产生两个mature miRNA。对应pre-miRNA茎环结构5‘和3‘序列的mature miRNA分别加后缀-5p和-3p以示区分,如rno-miR-325-5p和rno-miR-325-3p。

如果从同一个pre-miRNA成熟的两个mature miRNA的相对表达量已知,表达量高者加后缀*,如hsa-miR-17*比hsa-miR-17表达量高。

对于仅相差1-2个碱基的mature miRNA,加一个小写字母后缀以示区别,如hsa-miR-19a, hsa-miR-19b。

相关问题